Кодо́н (кодирующий тринуклеотид) — единица генетического кода, тройка нуклеотидных остатков (триплет) в ДНК или РНК, обычно кодирующих включение одной аминокислоты. Последовательность кодонов в гене определяет последовательность аминокислот в полипептидной цепи белка, кодируемого этим геном.
Содержание |
Поскольку существует 4 различных нуклеотида, то общее число кодонов равняется 64, из которых 61 кодируют определённые аминокислоты, а 3 оставшихся кодона (UGA, UAG и UAA) сигнализируют об остановке трансляции полипептидной цепи и называются стоп-кодонами. Кодон UAG в мРНК носит ещё название амбер-кодон (Amber), UGA — опал (Opal), а UAA — охра (Ochre). Стоп-кодоны выполняют важную функцию завершения (терминацию) сборки полипептидной цепи и также называются терминаторными кодонами. Некоторые из них вызывают обязательное прекращение синтеза, другие являются условными[1].
Кроме того, стоп-кодон, как кодон при котором не происходит включения аминокислоты в белок, ещё называют бессмысленным кодоном или нонсенс-кодоном.
Стартовым кодоном у эукариотических организмов является триплет AUG в мРНК, кодирующий метионин, с которого начинается образование полипептидной цепи в процессе трансляции. У некоторых прокариотов стартовыми кодонами так же являются GUG, AUU, CUG, UUG.
Так как в процессе биосинтеза белка в полипептидную цепь участвует всего 20 аминокислот, то различные кодоны могут кодировать одинаковые аминокислоты, такие кодоны принято называть изоакцепторными кодонами.
| 1-е основание |
2-е основание | |||
|---|---|---|---|---|
| U,dT | C,dC | A,dA | G,dG | |
| U,dT |
UUU (Phe/F) Фенилаланин |
UCU (Ser/S) Серин |
UAU (Tyr/Y) Тирозин |
UGU (Cys/C) Цистеин |
| C,dC |
CUU (Leu/L) Лейцин |
CCU (Pro/P) Пролин |
CAU (His/H) Гистидин |
CGU (Arg/R) Аргинин |
| A,dA |
AUU (Ile/I) Изолейцин |
ACU (Thr/T) Треонин |
AAU (Asn/N) Аспарагин |
AGU (Ser/S) Серин |
| G,dG |
GUU (Val/V) Валин |
GCU (Ala/A) Аланин |
GAU (Asp/D) Аспарагиновая кислота |
GGU (Gly/G) Глицин |
Расшифровка завершена в 1966 году[1].
По крайней мере у 16 типов организмов генетический код отличается от канонического. Например многие виды зелёных водорослей Acetabularia транслируют стандартные стоп-кодоны UAG и UAA в аминокислоту глицин, а гриб Candida интерпретирует РНК-кодон CUG не как лейцин, а как серин. А у митохондрий пекарских дрожжей (Saccharomyces cerevisiae) четыре из шести кодонов, обычно транслирующихся в лейцин, кодируют треонин.
Существование таких вариаций свидетельствует о возможной эволюции генетического кода.
Представители почти всех трёх доменов живых организмов иногда прочитывают стандартный стоп-кодон UGA как 21-ю аминокислоту селеноцистеин, не относящуюся к 20 стандартным. Селеноцистеин образуется при химической модификации серина на стадии, когда последний ещё не отсоединился от тРНК в составе рибосомы.
Аналогично у представителей двух доменов (архебактерий и бактерий) стоп-кодон UAG прочитывается как 22-я аминокислота пирролизин.
Отличия от универсального кода имеются и в митохондриальной ДНК (см. раздел Особенности).
Кодон.